Historias de resistencia del Valle de Guadalupe
No fue sino hasta el siglo XVIII cuando el Valle de Guadalupe recibió la visita de alguien distinto al pueblo kumiai. En 1795, el alférez Ildefonso Bernal exploró la zona y la nombró San Marcos. Un año después, durante un viaje de reconocimiento, el capitán José Joaquín de Arrillaga describió el valle en su diario de viaje.
Fue en este mismo paraje, el 25 de junio de 1834, cuando el padre Félix Caballero, presidente de las misiones dominicas, fundó la Misión de Nuestra Señora de Guadalupe del norte o de la frontera. Esta fue la última misión establecida en las Californias y dio origen a lo que hoy conocemos como la comunidad de Guadalupe.
El sistema misional tenía como objetivo evangelizar a los pueblos indígenas y establecer asentamientos permanentes. Para ello, se construyó una iglesia de adobe, se introdujeron prácticas agrícolas tecnificadas y se incorporó el ganado. En esta misión se concentraron las rancherías de Agua Escondida, San José, San Antonio Nécua y Rincón de los Encinos. Al inicio, la misión llegó a contar con la presencia de 400 personas indígenas.
Sin embargo, la llegada del sistema misional implicó una serie de cambios forzados:
«Se impusieron nuevas normas, se alteraron las formas de vida, modificaron la cultura y comenzó un cambio demográfico: la población mestiza aumentó mientras que la indígena disminuyó.«
En 1836, la misión de Guadalupe se convirtió en el centro de operaciones de la frontera misional dominica, reemplazando a la misión de San Vicente. Su sustento principal eran los extensos rebaños de ganado, junto con cultivos de olivo, viñedo y otros frutales.
En 1840, la misión fue destruida por integrantes kumiai de Nejí, liderados por Jatñil, quien hasta entonces había mantenido cierta alianza con los misioneros. Se cree que el ataque fue una respuesta al intento del padre Caballero de imponer la catequización forzada, lo cual generó un conflicto con las comunidades. Tras este hecho, la Misión de Nuestra Señora de Guadalupe fue abandonada y nunca volvió a funcionar como tal.